"Clandestina" plonge les spectateurs dans une toile sombre de peur et de tension psychologique, où l'amour se heurte à des circonstances politiques et morales complexes. À Miami, une ville baignée de soleil, l'histoire se déroule autour de Carlos, un homme en charge du rapatriement de clandestins, et Ana, une jeune femme en situation irrégulière.  

Ana, vivant dans l'ombre pour éviter les regards indiscrets, est surprise par la compréhension et l'attention de Carlos. À mesure qu'ils se rapprochent, leur lien se transforme en une relation amoureuse intense et interdite. Cependant, la réalité les rattrape rapidement lorsque Carlos est confronté à la dure réalité de son travail et aux lois strictes qu'il est censé faire respecter.